课程积分主要用于火影忍者手游忍者学校中的高级课程，不是积分赛、决斗场或普通商店的通用货币。角色达到20级并报名进入忍者学校后，打开活动页面，进入课程或研修界面，查看当前可选课程及其消耗，选择课程并确认即可。课程开始后会自动学习，完成后获得学分并提升对应属性；通常消耗积分越多的高级课程，提供的学分和属性成长越高，因此课程积分应优先投入高级课程，而不是随意兑换无关道具。
获取课程积分时，应先完成能够稳定参与的副本，再领取活跃度宝箱，最后通过组织成员互赠补充不足，活动页面开放特殊事件时也要及时完成，因为部分事件会额外提供课程积分或活动奖励。操作顺序建议是：先报名入学，再查看当天能获得的积分数量，随后根据课程价格安排消耗，最后确认自动学习状态。课程积分没有通用的固定兑换比例，实际消耗和可购买课程以活动界面显示为准；如果当前积分不足以购买目标课程，应先继续完成副本和活跃任务，不要提前把积分拆散使用。
课程选择应根据任务门槛和三项能力的差距决定，而不是只追求单项数值。忍者学校通常围绕忍术、幻术、体术进行培养，课程会分别提升对应能力并增加学分；当学分或属性达到指定条件后，可以解锁更高等级课程、研修任务和特殊事件。新玩家优先选择能补足最低属性要求的课程，避免出现一项很高、另外两项无法达标的情况；中期玩家应保持三项能力接近，方便完成不同研修任务；已经接近活动结束的玩家，则优先购买当前能开启的最高等级课程，把剩余积分转化为更多学分和属性。
研修任务的关键是队伍属性总和达到页面要求，队伍可以由同组织成员或系统提供的npc组成，因此课程积分不能只看个人成长，还要结合即将挑战的任务条件使用。积分较少时，先保证能触发下一档课程或完成当前属性门槛；积分充足时，再集中投入高消耗课程，以获得更高的学分和属性收益。不要把课程积分误认为直接提升主角战力的资源，也不要在未查看属性要求前连续购买同一类型课程；完成课程后还要手动领取已解锁的学分、任务和事件奖励，才能把积分投入转化为完整收益。
